2014年伊始 专注表观遗传12年 更专业 更放心

承接上篇，我们将接着介绍通过使用KnockTF 2.0数据库，从靶基因寻找上游转录因子/转录辅助因子的详细步骤！进入KnockTF 2.0数据库进入KnockTF 2.0数据库主页（http://www.licpathway.net/KnockTF/index.html）。主页对大家的到来表示欢迎，并对KnockTF 2.0数据库进行了简介，该数据库是T(co)F，即转录因子与转录辅助因子敲...

KnockTF 2.0的前世今生2019年末，李春权教授团队在Nucleic Acids Research杂志发表学术论文“KnockTF：a comprehensive human gene expression profile database with knockdown/knockout of transcription factors”，KnockTF 1.0数据库首次呈现。Kno...

上海嘉因于年初推出Rloop CUT&Tag服务R-loop是真核生物内广泛存在的三链核酸结构。近年来，R-loop被证明是基因表达和基因组稳定性的调节因子，引起了越来越多的关注。R-loop的全基因组定位可以帮助科学家们对Rloop的发生和功能进行精确研究。2024年2月嘉因生物推出Rloop CUT&Tag服务， 该服务基于CUT&Tag体系，利用S9.6抗体，在全基因组水平对R-loo...

      接着前五篇有关R-loop CUT&Tag的系列文章，包括R-loop概览、R-loop与表观遗传、R-loop与转录终止、R-loop CUT&Tag 系列文章之四-R-loop CUT&Tag技术原理和技术对比和R-loop CUT&Tag系列文章之五：上海嘉因实操R-loop CUT&Tag数据大解密，本篇文章将介绍R-loop与基因组稳定性的关联性。01R-loop与D...

01嘉因生物R-loop CUT&Tag介绍为了得到高质量的R-loop数据，嘉因生物基于公司已有的CUT&Tag体系，利用S9.6抗体，开发了针对R-loop的CUT&Tag流程，具体流程包括：磁珠结合细胞/细胞核、S9.6 抗体识别R-loop、IgG二抗孵育、PA-Tn5孵育、DNA回收与建库。R-loop CUT&Tag能够在动物细胞或者动物组织上得到R-loop文库，测序后的数据通...

01全基因组水平R-loop定位方法R-loop是特殊的三链核酸结构，包括DNA：RNA杂合链和一条游离的DNA单链，广泛存在于各种生物的基因组中，包括细菌、酵母、植物和人类等（R-loop CUT&Tag系列文章之一：R-loop概览——结构、形成、分布、调控因子及病理生理功能）。在生物体内，调控因子精准调控R-loop的产生，在基因调控和基因组稳定上发挥重要作用（R-loop CUT&T...

      接着R-loop概览和R-loop与表观调控，本篇文章将阐述R-loop与转录终止的关系，即R-loop可能导致Pol II（RNA polymerase II）暂停和转录终止的机制。01R-loop可能阻止Pol II回溯       R-loop可能能够阻止Pol II回溯。Pol II在转录延伸与回溯之间来回摆动，而R-loop的存在可能能够终止Pol II的回溯功能。0...

      承接上篇R-loop概览，本篇文章我们将介绍R-loop与表观遗传学调控的关系，主要针对染色质可及性和转录调节。       R-loop相关的染色质特征（组蛋白翻译后修饰）与启动子和转录起始位点处的转录特征类似，包括组蛋白H3 Lys4的单甲基化和三甲基化（H3K4me1和H3K4me3）、组蛋白H3 Lys27乙酰化（H3K27ac）和转录延伸（组蛋白H3 Lys36的三甲...

01R-loop是具有DNA-RNA杂交体的特殊三链核酸结构1976年，Thomas等首次通过电子显微镜观察到了R-loop结构。R-loop，又称R环，是含有DNA-RNA双链和被置换的DNA单链组成的特殊三链核酸结构。R-Loop结构示意图02R-loop可通过顺式（cis）和反式（trans）形成R-loop可通过顺式（cis）和反式（trans）形成，顺式R环是当RNA聚合酶转录时，...

      除了乳酸化修饰检测和乳酸浓度的检测，如果您的实验或组学数据中出现乳酸代谢基因异常变化，乳酸合成或运输基因异常变化，或者线粒体功能发生变化时，也可以考虑检测乳酸化修饰的异常。乳酸代谢异常相关指标01糖酵解强度相关基因及表型       乳酸化修饰水平与细胞内糖酵解强度是正相关的。糖酵解的大多数反应都是可逆的，但由己糖激酶、磷酸果糖激酶-1和丙酮酸激酶催化的这3步反应是控制糖酵解方...